Nowelizacje przepisów o podatku dochodowym nakładają na firmy nowe obowiązki sprawozdawcze. Kluczowa zmiana to cyfryzacja ksiąg, która wymaga od podatników CIT prowadzenia ich w programach komputerowych i przekazywania w strukturze JPK_KR_PD. Ustawodawca przewidział jednak wyjątki i w określonych przypadkach możliwy jest brak obowiązku przekazywania struktury JPK_KR_PD. Zanim firma wdroży nowe procesy, warto sprawdzić, czy na pewno podlega nowym wymogom, czy może skorzystać ze zwolnienia.
Kiedy możliwy jest brak obowiązku przekazywania struktury JPK_KR_PD?
JPK_KR_PD to Jednolity Plik Kontrolny Księgi Rachunkowe Podatek Dochodowy, nowy obowiązek dla podatników podatku dochodowego od osób prawnych polegający na prowadzeniu ksiąg rachunkowych przy użyciu programów komputerowych i stosowanym raportowaniu do urzędu w postaci elektronicznego pliku w odpowiedniej strukturze, przy zachowaniu terminów określonych w przepisach.
W ustawie o podatku dochodowym od osób prawnych w art. 9 wprowadzony obowiązek elektronicznego prowadzenia i przesyłania ksiąg będzie określony dla podatników podatku dochodowego od osób prawnych prowadzących księgi rachunkowe. Zgodnie z art. 9 ust. 1c ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych podatnicy prowadzący księgi rachunkowe są obowiązani prowadzić te księgi przy użyciu programów komputerowych oraz przesłać te księgi właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego po zakończeniu roku podatkowego, w terminie do dnia upływu terminu złożenia zeznania, o którym mowa w art. 27 ust. 1, albo deklaracji, o której mowa w art. 28r ust. 1, za pomocą środków komunikacji elektronicznej, w postaci elektronicznej odpowiadającej strukturze logicznej, o której mowa w art. 193a § 2 Ordynacji podatkowej, na zasadach dotyczących przesyłania ksiąg podatkowych lub ich części określonych w przepisach wydanych na podstawie art. 193a § 3 Ordynacji podatkowej.
Oznacza to, że podatnicy podatku dochodowego od osób prawnych, którzy prowadzą księgi rachunkowe, mają co do zasady obowiązek:
- prowadzić księgi przy użyciu programów komputerowych, oraz
- po zakończeniu roku podatkowego przekazać je właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego w postaci elektronicznej, w odpowiedniej strukturze logicznej w terminie do dnia upływu terminu złożenia zeznania z art. 27 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych albo do dnia upływu terminu złożenia zeznania deklaracji z art. 28r ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.
Przy czym wejście w życie tego obowiązku odbywa się zgodnie z harmonogramem przewidzianym w ustawie zmieniającej. Szczegółowy harmonogram wprowadzenia struktury JPK_KR_PD opisaliśmy w artykule: JPK_KR_PD – jak przygotować księgi rachunkowe do nowych wymagań?
Zwolnienie z obowiązku przesyłania struktury JPK_KR_PD
Zgodnie z art. 9 ust. 1d ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych z obowiązku, o którym mowa w ust. 1c, są zwolnieni podatnicy:
- zwolnieni od podatku na podstawie art. 6 ust. 1, z wyjątkiem fundacji rodzinnych;
- o których mowa w art. 27a;
- prowadzący uproszczoną ewidencję przychodów i kosztów.
Zatem wymienieni powyżej podatnicy są zwolnieni z elektronicznego przekazywania ksiąg rachunkowych, czyli struktury JPK_KR_PD. Przy czym art. 6 ust. 1 odnosi się m.in. do jednostek budżetowych. Natomiast art. 27a ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych stanowi, że zeznanie, o którym mowa w art. 27 ust. 1, może być składane w postaci papierowej przez podatników, którzy osiągają wyłącznie dochody wolne od podatku na podstawie art. 17 ust. 1 oraz nie są obowiązani do sporządzenia deklaracji lub informacji, o których mowa w art. 35 ust. 10, art. 38 ust. 1a i 1b, art. 39 ust. 1-4, art. 42 ust. 1a-4, art. 42a ust. 1 i art. 42e ust. 5 i 6 Ustawy z dnia 26 lipca 1991 roku o podatku dochodowym od osób fizycznych. Oznacza to, że jednostki chcące skorzystać ze zwolnienia z obowiązku przekazywania struktury JPK_KR_PD, o których mowa w art. 27a ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych, muszą osiągać wyłącznie dochody wolne od podatku (bez żadnych wyjątków, wszystkie dochody muszą być wolne od podatku dochodowego od osób prawnych).
Brak obowiązku przekazywania struktury JPK_KR_PD u podatników o dochodach wolnych od podatku w interpretacji indywidualnej
Interpretacja indywidualna (sygn. 0114-KDIP2-2.4010.247.2025.1.PK) z 11 lipca 2025 roku wydana przez Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej dotyczy braku obowiązku przekazywania struktury JPK_KR_PD u podatników o dochodach wolnych od podatku dochodowego od osób prawnych. Przedmiotem interpretacji było ustalenie, czy Samodzielny Publiczny ZOZ może skorzystać ze zwolnienia z obowiązku przesyłania po zakończeniu roku ksiąg rachunkowych w strukturze JPK_KR_PD (art. 9 ust. 1c ustawy o CIT) na podstawie art. 9 ust. 1d pkt 2 CIT w zw. z art. 27a CIT.
Wnioskodawca jest Samodzielnym Publicznym Zakładem Opieki Zdrowotnej, a statutowym celem działania szpitala jest ochrona zdrowia – zapewnienie świadczeń zdrowotnych oraz promocja zdrowia. Szpital korzysta ze zwolnienia przedmiotowego w podatku dochodowym od osób prawnych na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 4 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych jako jednostka przeznaczająca dochód na cele statutowe w zakresie ochrony zdrowia. Przepis art. 17 ust. 1 pkt 4 updop przewiduje zwolnienie o charakterze warunkowym dla podatników, których celem statutowym jest określona w ustawie działalność, m.in. w zakresie ochrony zdrowia, pomocy społecznej i kształcenia studentów. Zwolnienie obejmuje dochody w części przeznaczonej na cele statutowe. Dochód przeznaczony na wydatki, które nie stanowią realizacji celu statutowego, podlegają opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób prawnych, co szpital rozlicza w ramach deklaracji rocznej, dochowując obowiązku rozliczenia się z podatku dochodowego od dochodu w części nieprzeznaczonej na cele statutowe. Szpital dokonuje wydatków środków na cele niestatutowe, tj. m.in. na zapłatę składek na PFRON, kar, kosztów sądowych, odsetek budżetowych. Wydatki te, zgodnie z art. 16 updop, nie stanowią kosztów uzyskania przychodów. Szpital prowadzi księgi rachunkowe przy użyciu programu komputerowego. Zadano pytanie, czy szpital będzie zwolniony z obowiązku przesyłania właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego ksiąg rachunkowych po zakończeniu roku podatkowego (JPK_KR_PD).
Jak podkreślił Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej w uzasadnieniu interpretacji podatkowej, obowiązujące przepisy (art. 27a w związku z art. 9 ust. 1d ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych) regulują uprawnienia podmiotów do składania zeznania w postaci papierowej podatników, którzy osiągają wyłącznie dochody wolne od podatku na postawie art. 17 ust. 1. Natomiast z wniosku wynika, że nie wszystkie dochody osiągane przez szpital mogą korzystać ze zwolnienia z art. 17 ust. 1 pkt 4 ustawy o CIT, który to zwalnia dochody podatników, których cele statutowe to m.in. ochrona zdrowia, jedynie w części przeznaczonej na te cele, natomiast szpital dokonuje również wydatków na cele niestatutowe, tj. m.in. na zapłatę składek na PFRON, kar, kosztów sądowych, odsetek budżetowych. Szpital rozlicza je w ramach deklaracji rocznej, dochowując obowiązku rozliczenia się z podatku dochodowego od dochodu w części nieprzeznaczonej na cele statutowe.
W konsekwencji Dyrektor KIS uznał, że wnioskodawcy (szpitala) nie obejmuje zwolnienie wskazane w art. 9 ust. 1d pkt 2 ustawy o CIT. Tym samym obowiązek przesyłania plików JPK_CIT obejmie wnioskodawcę zgodnie z harmonogramem wskazanym w art. 66 ust. 2 ustawy zmieniającej. Zatem szpital nie będzie zwolniony z obowiązku przesyłania właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego ksiąg rachunkowych po zakończeniu roku podatkowego w terminie do dnia upływu terminu złożenia zeznania, o którym mowa w art. 27 ust. 1 ustawy o CIT, albo deklaracji, o której mowa w art. 28r ust. 1 ustawy o CIT, za pomocą środków komunikacji elektronicznej, w postaci elektronicznej odpowiadającej strukturze logicznej, o której mowa w art. 193a § 2 Ordynacji podatkowej, na zasadach dotyczących przesyłania ksiąg podatkowych lub ich części określonych w przepisach wydanych na podstawie art. 193a § 3 Ordynacji podatkowej.
